Per la mia poca esperienza ti sò rispondere meglio alla seconda.
Rispetta sempre le misure interne, nel libro "Nidi Artificiali" parla di 17,5 cm... mezzo cm più mezzo meno non cambia (se ricordo bene i miei sono 16x16). Avendone fatti 3 un consiglio mi sento di dartelo, con le tavole da 3cm dovrai fare le tue per portarlo in giro e poi posizionarlo, io li ho fatti con tavole da 2cm ed erano belli pesanti... immagino i tuoi cosa peserebbero.
Magari avresti sicuramente più isolamento termico, ma alla fine le tavole da 2 cm garantiscono già un buon isolamento.
Se in zona conosci qualche falegname per lui portarle a 2 cm è uno scherzo